一個清關公司正常運作流程是什么樣子的，我們知道一換單當貨物到達港口之后，為了能順利提貨，就需要到船公司完成換單工作，而貨代相當于是一個中間人角色，跟貨主拿提單，然后到船公司進行換單，這期間需要跟貨主簽份報關委托書。
電子申報完成換單工作之后，就需要進入電子申報環節，在申報的過程中，需要相關人員如實填寫相關內容，如果在檢查的過程中，發現實際貨物與申報的內容不符，那么貨物就會被海關扣下，如果存在多次申報不符，或者是瞞報的行為，海關就會采取懲罰措施，嚴重的情況下，還會按照走私罪進行懲罰，所以在申報環節一定要提高重視，切不可隨意填寫，當內容填寫完成之后，就需要發送給海關，并且聯系其放行。
報檢當電子申報工作完成之后，就需要進入到報檢環節，在此過程中，需要申請人攜帶相關材料，到商檢部門申請檢驗，確保商品準許入境，并且能夠合法銷售，這是必須要履行的手續之一，只有商檢部門檢驗完畢，并且確保貨品通過審查之后，申請人才能夠拿到入境貨物通關單，如果在審查的過程中，商檢部門認定此物品無法在國內銷售，那么申請人將無法拿到通關單，自然也就不能順利的從海關那里提貨，需要注意的一點是，并不是所有的貨物，都需要經歷報檢這一環節，只有國家規定報檢的商品，才需要經過這個流程。
四現場交接單當所有資料全部準備，妥當之后，就需要申請人拿著這些材料，去找海關進行現場交接。
五查驗交接過程中，貨主并不能夠直接將貨物提走，海關需要按照其申報的內容進行查驗，查驗的方式有兩種，可以選擇抽查或者是全部檢查，這些都是隨機性的進行查驗，最主要的目的，就是為了檢查實際的貨物，和申報的是否一致，確保不會出現虛報瞞報或走私行為。